fa بررسی اثرات تغییر بیان ریز آر ان ای های سلولی ناشی از ویروس پاپیلوم انسانی در سلول های سرطانی سنگفرشی سر و گردن در سطح پروفیل بیان ژنی تخصصي Special كاربردي Applicable <p class="Text" dir="RTL" style="line-height:150%"><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">زمینه و هدف:</span></span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> ویروس پاپیلوم انسانی</span></span><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">(</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:11.0pt;">HPV</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">)</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">نقش مهمی در برخی از بدخیمی&shy;های انسانی ایفاء کرده و</span></span></span> <span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">منجر به تغییر سطوح بیان نرمال ریز آر ان ای های سلولی می شود. در این مقاله اثرات چنین تغییراتی بر روی نمونه های تومور سرطانی سنگفرشی سر و گردن در سطح پروفیل ژنی بررسی شد.</span></span></span><br> <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">روش&shy; ها: </span></span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">در این مطالعه توصیفی- تحلیلی پروفیل بیان ژنی 36 نمونه تومور در دو گروه با و بدون ویروس مقایسه شدند. ژن&shy; های با بیان متفاوت در دو گروه از لحاظ توانایی تفکیک نمونه ها و نیز همپوشانی با دسته بندی&shy; های هسته &shy;شناسی ژنی سنجیده شدند. به علاوه، اثر اهداف سلولی تایید شده 11 ریز آر ان ای های سلولی گزارش شده بر روی پروفیل بیان ژنی نمونه های تومور با استفاده از آنالیز خوشه‌ بندی سلسله ‌مراتبی و آنالیز غنی &shy;سازی مجموعه ژنی بررسی گردید. </span></span></span><br> <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">نتایج:</span></span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> بر خلاف آزمون&shy; های غیر نظارتی، ژن &shy;های استخراج شده با بیان متفاوت، مشتمل بر 47 و 7 ژن واحد به ترتیب با بیان افزایش یا کاهش یافته، به خوبی دو گروه تومور را در آنالیز خوشه‌بندی سلسله‌مراتبی تفکیک کرده (0/0001=</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">P</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">). این ژن&shy; ها و عمدتا در تنظیم چرخه سلولی نقش داشتد (0/05</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">q-value&le;</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">). اهداف ریز آر ان ای&shy; های سلولی با بیان افزایش &shy;یافته در گروه توموری با ویروس غنی &shy;تر یافت شدند (0/05</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">q-value&le;</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">). در بین ریز آر ان ای &shy;های سلولی بررسی شده، </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">hsa-miR-155-5p</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> و </span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;">hsa-miR-221-3p</span></span></span> <span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">به صورت معنی &shy;داری پروفیل بیان ژنی نمونه های تومور را تغییر دادند (0/05</span></span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:12.0pt;">q-value&le;</span></span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">).</span></span></span><br> <strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">نتیجه گیری:</span></span></span></strong><span style="color:black;"><span style="font-family:b nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> ویروس پاپیلوم انسانی با تغییر سطوح بیان ریز آر ان ای&shy;های سلولی می&shy; تواند بر روی پروفیل بیان ژنی سرطان سلول&shy; های سنگفرشی سر و گردن اثر گذارد. تایید نتایج این مطالعه با استفاده از روش های آزمایشگاهی پیشنهاد می &shy;شود.</span></span></span></p> <strong>Background and aim: </strong>Human Papilloma Virus plays an important role in some of human malignancies and causes alterations in normal expression levels of cellular microRNAs. In this paper, we evaluated the effects of such changes on Head and Neck Squamous Cell Carcinoma tumor samples at gene expression profile level.<br> <strong>Methods</strong>: in this descriptive-analytical study, gene expression profiles of 36 tumor samples were compared in two groups: with or without virus. Differentially expressed genes among the two groups were judged in terms of their ability in segregating the tumor samples and also their overlap with Gene Ontology Biological Function categories. Furthermore, using hierarchical clustering analysis and Gene Set Enrichment Analysis methods, the effect of confirmed cellular targets of 11 reported cellular microRNAs on the gene expression profiles of our samples was assessed.<br> <strong>Results</strong>: Unlike unsupervised methods, differentially expressed genes, including 47 and 7 unique induced and suppressed genes, respectively, discriminated perfectly the two sample sets in a hierarchical clustering analysis (P=0.0001). These genes were primarily engaged in regulation of cell cycle (FDR adjusted P&le;0.05). Targets of induced cellular microRNAs were found enriched in virus-positive set (FDR adjusted P&le;0.05). Among analyzed cellular miRNAs, hsa-miR-155-5p and hsa-miR-221-3p change the gene expression profile of tumor samples significantly (FDR adjusted P&le;0.05).<br> <strong>Conclusion</strong>: deregulating expression levels of cellular microRNAs, HPV is capable of affecting the gene expression profiles of Head and Neck Squamous cell Carcinoma tumors. It is suggested to confirm the results of this study using experimental methods. ویروس پاپیلوم انسانی, سرطان سلول های سنگفرشی سر و گردن, ریز آر ان ای, پروفیل بیان ژنی Human Papilloma Virus, Squamous cell carcinoma of the head and neck, microRNA, Gene Expression Profiling 26 38 http://jms.thums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-36&slc_lang=fa&sid=1 Mohsen Navari محسن نواری mohsen.navari@gmail.com 10031947532846005758 10031947532846005758 Yes Department of Virology, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran گروه ویروس شناسی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران Mostafa Ibrahimi مصطفی ابراهیمی 10031947532846005759 10031947532846005759 No Department of Clinical Biochemistry, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran. Iran گروه بیوشیمی بالینی، دانشکده علوم پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران Milad Mohammadoo-khorasani میلاد محمدوخراسان 10031947532846005760 10031947532846005760 No Department of Clinical Biochemistry, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran. Iran گروه بیوشیمی بالینی، دانشکده علوم پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران Arash Arashkia آرش آرش کیا maryamtatary@yahoo.com 10031947532846005761 10031947532846005761 No Department of Virology, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran گروه ویروس شناسی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران